Charlie Heller (Rami Malek) is een briljante maar teruggetrokken CIA-codekraker die in een kelderkantoor op het hoofdkwartier in Langley werkt. Zijn leven verandert drastisch wanneer zijn vrouw omkomt bij een terroristische aanslag in Londen. Wanneer zijn leidinggevenden weigeren in te grijpen, besluit hij zelf actie te ondernemen. Wat volgt is een gevaarlijke wereldwijde zoektocht naar de daders. Gewapend met niets anders dan zijn scherpe geest ontwijkt hij zijn achtervolgers en zint hij op wraak.
Naast Rami Malek zijn ook Rachel Brosnahan, Caitríona Balfe, Michael Stuhlbarg en Laurence Fishburne in de film te zien. The Amateur is geregisseerd door James Hawes, met een script van Ken Nolan en Gary Spinelli, gebaseerd op het boek van Robert Littell.