Aan het einde van de 23e eeuw nemen gelegenheidsgasten Pavel Checkov, Montgomery Scott en kapitein James T. Kirk de gloednieuwe Enterprise-B een eerste vlucht. Deze eerste reis, enkel bedoelt om het schip in te wijden, loopt uit op een ramp wanneer twee transportschepen in nood komen bij een mysterieuze energierimpel. De onvoorbereide Enterprise redt een handvol passagiers maar Kirk moet het bekopen met zijn leven. 78 jaar later krijgt kapitein Picard het aan de stok met de voortvluchtige wetenschapper Tolian Soran die volledige zonnestelsels wil vernietigen. En de enige man die deze krankzinnige geleerde kan stoppen is al 78 jaar dood.