Missing in Brooks County volgt de reis van twee families die naar Brooks County zijn gekomen om hun vermiste dierbaren te zoeken. Tijdens hun zoektocht naar antwoorden stuiten ze op een spookachtig gebied waar de dood aan de orde van de dag is.
Deze aangrijpende documentaire is tevens een diep menselijk portret van de wetshandhavers, mensenrechtenactivisten en andere betrokkenen die geconfronteerd worden met de levensbedreigende gevolgen van een falend systeem.