Na de gebeurtenissen in New York met de Avengers leidt Captain America, alias Steve Rogers, een rustig leventje in Washington. Maar wanneer een van zijn collega's van de veiligheidsdienst S.H.I.E.L.D. wordt aangevallen, komt Steve in een web van intriges terecht dat het einde van de wereld kan betekenen. Samen met Black Widow en The Falcon - de enigen die hij nog kan vertrouwen - gaat hij de strijd aan met professionele huurmoordenaars. Al snel staan ze oog in oog met hun grootste vijand: The Winter Soldier.